Paralel Anneler, hastanede doğum yapan iki kadının yollarının kesişmesiyle başlayan ve yıllar sonra beklenmedik bir bebek karışıklığının peşine düşen Janis’in hikayesini anlatıyor. Janis, fotoğraf çekimi sırasında Arturo ile tanışıyor ve kısa sürede onunla yakınlaşıyor. Hamile kaldığında, Arturo’nun evli olduğunu ve eşinin ağır hasta olduğunu öğrenince bebeğini tek başına büyütmeye karar veriyor. Doğum için hastaneye gittiğinde, aynı odada genç ve yalnız bir anne adayı olan Ana ile tanışıyor. İkisi de aynı gün doğum yapıyor ve sonrasında iletişimde kalıyor. Bir süre sonra Janis, kendi bebeği Cecilia ile ilgili şüpheye düşüyor ve yaptırdığı testte beklemediği bir sonuç alıyor. Ardından Ana’nın bebeği Anita’nın öldüğünü öğreniyor ve hastanede bebeklerin karışmış olabileceğini anlıyor. Janis, gerçeği Ana’ya söylemek zorunda kalıyor, ama bu karar ikisini de zor bir yola sokuyor. Peki Janis, yaptığı seçimin sonuçlarıyla nasıl yüzleşecek?