Sinek Kuşu, 1994 Seul’ünde 14 yaşındaki Eun-hee’nin okulda, evde ve kendi içinde yaşadığı zorlanmaları anlatıyor. Eun-hee, ailesiyle çatışıyor, okulda baskı görüyor ve kendine bir yer bulmaya çalışıyor. Seongsu Köprüsü’nün çöküşü, onun günlük hayatını sarsan önemli bir olay oluyor ve Eun-hee’nin çevresindeki insanlarla ilişkilerini değiştiriyor. Bu süreçte yeni arkadaşlar ediniyor, sokaklarda ve sınıfta kendi sesini duymaya çalışıyor. Park Ji-hoo’nun Eun-hee’si ile Kim Sae-byeok’un Young-ji’si, bu dönemde onun hayatına dokunan iki önemli isim oluyor. Seol Hye-in’in Yu-ri’si de Eun-hee’nin okul günlerinde yanında yer alıyor. Eun-hee, yaşadıkları arasında büyümeye, anlamaya ve kendi yolunu bulmaya çalışıyor.