X-Men: Birinci Sınıf'te, 1960'ların başında Charles Xavier ile Erik Lehnsherr tanışır ve mutantların izini sürmeye başlar. İkili, farklı yeteneklere sahip insanları bulur, onlara yol göstermeye çalışır. Charles, bu gücü barış içinde kullanmak ister. Erik ise yaşadıkları acıların hesabını sormaya daha yakındır. Bu sırada Sebastian Shaw, mutant gücünü kendi çıkarı için kullanır ve dünyayı kendi planına göre yönlendirmeye çalışır. Charles, Erik, Raven ve Moira, bu tehdide karşı birlikte hareket eder. Ancak Charles ile Erik arasında büyüyen fikir ayrılığı, onları aynı tarafta tutmayı zorlaştırır.